MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC2

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012795	A	7	7	192	198	100 %	0 %	0 %	0 %	239828746
2	NC_012795	CAT	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828746
3	NC_012795	GAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828746
4	NC_012795	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828746
5	NC_012795	TCA	2	6	439	444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828746
6	NC_012795	TTA	2	6	580	585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828746
7	NC_012795	CAAA	2	8	619	626	75 %	0 %	0 %	25 %	239828746
8	NC_012795	T	6	6	640	645	0 %	100 %	0 %	0 %	239828746
9	NC_012795	TTA	2	6	653	658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828746
10	NC_012795	TTG	2	6	707	712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828746
11	NC_012795	CAA	3	9	740	748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828746
12	NC_012795	CAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828746
13	NC_012795	GA	4	8	786	793	50 %	0 %	50 %	0 %	239828746
14	NC_012795	CAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828746
15	NC_012795	TTG	2	6	866	871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828746
16	NC_012795	CAG	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828747
17	NC_012795	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828747
18	NC_012795	AT	3	6	1006	1011	50 %	50 %	0 %	0 %	239828747
19	NC_012795	GCA	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828747
20	NC_012795	A	6	6	1036	1041	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
21	NC_012795	GT	3	6	1042	1047	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
22	NC_012795	GT	3	6	1099	1104	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
23	NC_012795	GT	3	6	1159	1164	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
24	NC_012795	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828747
25	NC_012795	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	239828747
26	NC_012795	A	6	6	1267	1272	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
27	NC_012795	A	7	7	1291	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
28	NC_012795	ATA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828747
29	NC_012795	ATG	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828747
30	NC_012795	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828747
31	NC_012795	ACC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828747
32	NC_012795	GGT	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828747
33	NC_012795	GACA	2	8	1456	1463	50 %	0 %	25 %	25 %	239828747
34	NC_012795	GT	3	6	1480	1485	0 %	50 %	50 %	0 %	239828747
35	NC_012795	AGAT	2	8	1501	1508	50 %	25 %	25 %	0 %	239828747
36	NC_012795	AGA	2	6	1509	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828747
37	NC_012795	ATCT	3	12	1522	1533	25 %	50 %	0 %	25 %	239828747
38	NC_012795	CT	3	6	1532	1537	0 %	50 %	0 %	50 %	239828747
39	NC_012795	A	6	6	1609	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
40	NC_012795	GAT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828747
41	NC_012795	GAAGCG	2	12	1824	1835	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	239828747
42	NC_012795	TGC	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828747
43	NC_012795	A	6	6	1965	1970	100 %	0 %	0 %	0 %	239828747
44	NC_012795	GGAA	2	8	1975	1982	50 %	0 %	50 %	0 %	239828747
45	NC_012795	GA	3	6	2320	2325	50 %	0 %	50 %	0 %	239828748
46	NC_012795	A	6	6	2408	2413	100 %	0 %	0 %	0 %	239828748
47	NC_012795	GTTTA	2	10	2436	2445	20 %	60 %	20 %	0 %	239828748
48	NC_012795	CAATT	2	10	2458	2467	40 %	40 %	0 %	20 %	239828748
49	NC_012795	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828748
50	NC_012795	GAT	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828748
51	NC_012795	AGAA	2	8	2567	2574	75 %	0 %	25 %	0 %	239828748
52	NC_012795	A	6	6	2573	2578	100 %	0 %	0 %	0 %	239828748
53	NC_012795	CTG	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828748
54	NC_012795	GCAA	2	8	2626	2633	50 %	0 %	25 %	25 %	239828748
55	NC_012795	TA	3	6	2723	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	239828748
56	NC_012795	GTG	3	9	2976	2984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828748
57	NC_012795	TTTA	2	8	3096	3103	25 %	75 %	0 %	0 %	239828749
58	NC_012795	A	8	8	3168	3175	100 %	0 %	0 %	0 %	239828749
59	NC_012795	ATC	2	6	3282	3287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828749
60	NC_012795	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828749
61	NC_012795	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828749
62	NC_012795	T	7	7	3473	3479	0 %	100 %	0 %	0 %	239828749
63	NC_012795	AAT	2	6	3498	3503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828749
64	NC_012795	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828749
65	NC_012795	TGC	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828749
66	NC_012795	GCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828749
67	NC_012795	CAG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828749
68	NC_012795	TAG	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828749
69	NC_012795	TCT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828749
70	NC_012795	TTG	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828749
71	NC_012795	GGAT	2	8	3879	3886	25 %	25 %	50 %	0 %	239828749
72	NC_012795	TGT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
73	NC_012795	GCT	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828750
74	NC_012795	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	239828750
75	NC_012795	AAGC	2	8	4574	4581	50 %	0 %	25 %	25 %	239828750
76	NC_012795	TAA	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
77	NC_012795	AT	3	6	4780	4785	50 %	50 %	0 %	0 %	239828750
78	NC_012795	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828750
79	NC_012795	ATG	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828750
80	NC_012795	TC	3	6	4846	4851	0 %	50 %	0 %	50 %	239828750
81	NC_012795	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
82	NC_012795	A	6	6	4941	4946	100 %	0 %	0 %	0 %	239828750
83	NC_012795	TTG	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
84	NC_012795	T	6	6	4988	4993	0 %	100 %	0 %	0 %	239828750
85	NC_012795	AAT	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
86	NC_012795	TGT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
87	NC_012795	TTGT	2	8	5116	5123	0 %	75 %	25 %	0 %	239828750
88	NC_012795	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828750
89	NC_012795	TA	3	6	5163	5168	50 %	50 %	0 %	0 %	239828750
90	NC_012795	TGA	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828751
91	NC_012795	TTTG	2	8	5946	5953	0 %	75 %	25 %	0 %	239828751
92	NC_012795	TTA	2	6	5968	5973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828751
93	NC_012795	ATG	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828751
94	NC_012795	T	6	6	6139	6144	0 %	100 %	0 %	0 %	239828751
95	NC_012795	A	6	6	6219	6224	100 %	0 %	0 %	0 %	239828751
96	NC_012795	AAAATA	2	12	6241	6252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	239828751
97	NC_012795	AAAG	2	8	6266	6273	75 %	0 %	25 %	0 %	239828751
98	NC_012795	ACA	2	6	6573	6578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828752
99	NC_012795	CAA	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828752
100	NC_012795	A	6	6	6635	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
101	NC_012795	A	6	6	6654	6659	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
102	NC_012795	AAG	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828752
103	NC_012795	A	6	6	6706	6711	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
104	NC_012795	A	6	6	6714	6719	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
105	NC_012795	TAT	3	9	6798	6806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828752
106	NC_012795	TCAA	2	8	6812	6819	50 %	25 %	0 %	25 %	239828752
107	NC_012795	T	6	6	6837	6842	0 %	100 %	0 %	0 %	239828752
108	NC_012795	GAA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828752
109	NC_012795	TGTT	2	8	6899	6906	0 %	75 %	25 %	0 %	239828752
110	NC_012795	AGG	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239828752
111	NC_012795	AAT	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828752
112	NC_012795	ATT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828752
113	NC_012795	A	6	6	7015	7020	100 %	0 %	0 %	0 %	239828752
114	NC_012795	TGC	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828752
115	NC_012795	GTGA	2	8	7734	7741	25 %	25 %	50 %	0 %	239828753
116	NC_012795	A	6	6	7800	7805	100 %	0 %	0 %	0 %	239828753
117	NC_012795	ACC	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828753
118	NC_012795	GCA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828753
119	NC_012795	A	6	6	7953	7958	100 %	0 %	0 %	0 %	239828753
120	NC_012795	A	6	6	7968	7973	100 %	0 %	0 %	0 %	239828753
121	NC_012795	TGA	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828753
122	NC_012795	CTG	3	9	8014	8022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828753
123	NC_012795	G	6	6	8047	8052	0 %	0 %	100 %	0 %	239828753
124	NC_012795	AGG	2	6	8071	8076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239828753
125	NC_012795	GGT	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828753
126	NC_012795	GCT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828754
127	NC_012795	CTG	2	6	8253	8258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828754
128	NC_012795	ACA	2	6	8283	8288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828754
129	NC_012795	AAT	2	6	8314	8319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828754
130	NC_012795	TTC	2	6	8356	8361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828754
131	NC_012795	GAA	2	6	8370	8375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828754
132	NC_012795	TCC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239828754
133	NC_012795	CG	3	6	8451	8456	0 %	0 %	50 %	50 %	239828754
134	NC_012795	AT	3	6	8457	8462	50 %	50 %	0 %	0 %	239828754
135	NC_012795	TCA	3	9	8469	8477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828754
136	NC_012795	TTC	2	6	8481	8486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828754
137	NC_012795	TTC	2	6	8547	8552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828755
138	NC_012795	A	6	6	8656	8661	100 %	0 %	0 %	0 %	239828755
139	NC_012795	TTC	2	6	8669	8674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828755

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.